banner large

Subvarian BA.5 dari omicron tidak peduli bahwa Anda baru saja terkena Covid-19

Comment
X
Share

Polanya menjadi terlalu akrab: versi baru virus SARS-CoV-2 muncul dan mulai mendominasi kasus Covid-19 baru, hingga digantikan oleh versi virus yang bahkan lebih menular.

Tahun ini, subvarian dari varian virus omicron telah menguasai kasus di AS. Subvarian BA.1 memulai gelombang omicron. Kemudian pada bulan April, BA.2 menjadi mayoritas kasus. Pada bulan Mei, BA.2.12.1 mengambil alih. Sekarang BA.5 memimpin, memicu peningkatan rawat inap di seluruh negeri. Ini mungkin versi virus yang paling menular hingga saat ini.

Mengapa ini terus terjadi?

Ini evolusi. Semakin banyak virus menyebar, semakin banyak peluang yang dimilikinya untuk bermutasi, dan pada akhirnya beberapa dari mutasi tersebut akan memberikan keuntungan penularan kepada virus.

Omicron menunjukkan bahwa ia mahir menyebabkan infeksi ulang di antara orang-orang yang sebelumnya terpapar Covid-19. BA.5 tampaknya memiliki campuran mutasi yang sangat kuat yang menghindari perlindungan dari sistem kekebalan.

Kabar baiknya adalah bahwa vaksin Covid-19 masih memberikan perlindungan yang baik terhadap penyakit parah yang disebabkan oleh BA.5 dan menjaga tingkat kematian tetap rendah. Tetapi karena BA.5 menyebar begitu cepat, sebagian kecil orang yang sakit parah bertambah, perkembangan yang membuat frustrasi bagi semua orang yang rajin melakukan vaksinasi, penggunaan masker, dan jarak sosial.

Para ilmuwan sekarang memusatkan perhatian pada apa yang membuat BA.5 begitu lazim bahkan di era kekebalan yang meluas. Apa yang mereka pelajari dapat membantu menahan lonjakan saat ini dan melawan yang berikutnya, berpotensi memungkinkan mereka untuk merancang vaksin penguat yang lebih baik melindungi terhadap versi virus yang lebih baru.

Dan SARS-CoV-2 belum selesai berevolusi. Mencari tahu bagaimana varian seaneh omicron muncul dan bagaimana itu disetel ke BA.5 dapat membuka kunci alat untuk memprediksi dan mencegah varian lain sejak awal.

Mengapa BA.5 pandai menghindari sistem kekebalan kita

Jika virus memiliki tujuan, itu untuk membuat salinan dari dirinya sendiri. Mereka tidak memiliki alat untuk melakukannya sendiri, jadi mereka harus membajak sel dari host (yaitu, kita) untuk bereproduksi. Proses penyalinan bisa ceroboh, terutama dengan virus yang menggunakan RNA sebagai materi genetiknya, seperti SARS-CoV-2, sehingga mutasi berlimpah.

Sebagian besar perubahan ini merugikan virus atau tidak berpengaruh, tetapi beberapa dapat membuat virus menyebabkan penyakit yang lebih parah, menginfeksi lebih banyak orang, atau lebih baik bersembunyi dari sistem kekebalan. Ketika banyak orang telah divaksinasi atau sebelumnya terinfeksi, mutasi yang menyembunyikan virus memiliki keuntungan besar.

“Tingkat kekebalan yang tinggi dalam populasi kemungkinan memberikan tekanan seleksi pada virus dan virus berkembang untuk mencoba mengatasi kekebalan itu,” kata Daniel Barouch, direktur Pusat Penelitian Virologi dan Vaksin di Beth Israel Deaconess Medical. Tengah.

Dengan SARS-CoV-2, ketika versi virus mengakumulasi kelompok mutasi yang berbeda dan dianggap sebagai ancaman kesehatan masyarakat, itu diklasifikasikan sebagai varian dan menerima penunjukan huruf Yunani dari Organisasi Kesehatan Dunia.

Pengelompokan mutasi yang lebih kecil dalam suatu varian diklasifikasikan sebagai subvarian, sering digambarkan dengan huruf dan angka berdasarkan warisan genetiknya, meskipun garis antara varian dan subvarian dapat kabur. Menambah kebingungan, SARS-CoV-2 dapat mengalami rekombinasi, di mana ia memadukan sifat-sifat dari dua garis keturunan yang berbeda. Karena para peneliti telah meningkatkan pelacakan genom virus, mereka melihat perubahan pada tingkat yang lebih cepat.

“Apa yang mencolok adalah kecepatan di mana kita melihat virus berevolusi,” kata Barouch.

Omicron mencontohkan bagaimana perubahan besar dan kecil pada virus dapat berakar. Ketika pertama kali muncul pada akhir 2021, ia menonjol karena rangkaian mutasi berbeda yang membedakannya dari varian Covid-19 lainnya. Para ilmuwan tidak dapat mengetahui warisannya karena tidak mirip dengan varian utama yang beredar. Nenek moyang terdekatnya yang diketahui berasal dari tahun 2020, zaman kuno dalam hal evolusi virus.

Ada beberapa teori, namun. Omicron atau pendahulunya mungkin telah beredar tanpa terdeteksi. Ini mungkin telah berkembang pada pasien dengan sistem kekebalan yang terganggu, memberikan virus waktu yang sangat lama untuk bereplikasi dan memperoleh mutasi dalam satu inang. Mungkin juga telah melompat kembali ke manusia dari hewan lain.

Pada pohon filogenetik virus, diagram yang menggambarkan hubungan evolusioner di antara berbagai versi virus, omicron berada di cabang yang jauh dari varian lainnya. Titik-titik mewakili urutan yang dilaporkan, dan jarak di antara mereka mencerminkan jumlah mutasi yang membaginya:

Pohon filogenetik varian SARS-CoV-2.

Pohon filogenetik ini menunjukkan betapa berbedanya varian omicron dari SARS-CoV-2 (kiri bawah) dari varian lain, seperti delta.
regangan berikutnya

Dibandingkan dengan SARS-CoV-2 versi asli yang muncul di Wuhan, China, pada 2019, omicron memiliki lebih dari 50 mutasi. Tiga puluh mutasi ini berada di protein lonjakan virus. Ini adalah bagian runcing yang menonjol dari virus dan membuatnya tampak seperti mahkota di bawah mikroskop.

Paku langsung menempel pada sel manusia untuk memulai proses infeksi. Mereka juga merupakan titik perlekatan utama untuk antibodi, protein dari sistem kekebalan yang mengenali dan menghambat virus. Jadi perubahan pada protein lonjakan dapat mengubah seberapa efisien virus dapat bereproduksi dan seberapa baik sistem kekebalan dapat menghentikannya.

Sejak omicron muncul, urutan genetik SARS-CoV-2 menunjukkan bahwa virus telah mengalami perubahan yang lebih halus. Hanya ada segelintir mutasi yang memisahkan BA.5 dari subvarian sebelumnya seperti BA.2, tetapi mutasi itu cukup untuk memberikan keuntungan besar bagi virus. BA.4 dan BA.5 sebenarnya memiliki protein lonjakan yang hampir identik dan berbeda dalam mutasi di bagian lain virus.

Antibodi sangat pilih-pilih tentang bagian virus yang akan mereka tempel, sehingga perubahan kecil pada bagian ini dapat membuat antibodi menjadi kurang efisien. Ini adalah berita buruk untuk beberapa perawatan berbasis antibodi untuk Covid-19, beberapa di antaranya tidak lagi direkomendasikan untuk digunakan melawan omicron. Tetapi obat lain seperti Paxlovid masih bekerja melawan subvarian yang lebih baru.

Mikrograf elektron transmisi partikel virus SARS-CoV-2 (varian UK B.1.1.7), diisolasi dari sampel pasien dan dibudidayakan dalam kultur sel.

Virus SARS-CoV-2 bertatahkan paku yang memungkinkannya untuk memulai infeksi.
NIH/NAID/IMAGE.FR/BSIP/Universal Images Group melalui Getty Images

Sekelompok kecil subvarian yang mengambil alih dunia adalah pergeseran dari bagaimana virus bermutasi di awal pandemi. “[T]Fakta bahwa subvarian omicron ini menjadi begitu dominan dan menyebar ke seluruh dunia berbeda dari apa yang kita lihat, misalnya delta, di mana subvariannya (yang tidak pernah mendapat huruf terpisah) tidak pernah mendominasi dengan cara yang sama,” kata Emma Hodcroft, seorang ahli molekuler. ahli epidemiologi di University of Bern, dalam email. Bahkan subvarian omicron telah mengalami rekombinasi.

Ini sebagian merupakan konsekuensi dari peningkatan global dalam paparan virus. Ada beberapa sistem kekebalan yang tersisa yang tidak terbiasa dengan SARS-CoV-2. Jadi, sifat terpenting BA.5 untuk keberhasilannya adalah seberapa baik ia dapat menghindari antibodi dan sel darah putih orang yang sebelumnya terinfeksi atau divaksinasi.

Barouch dan kolaboratornya baru-baru ini melaporkan di Jurnal Kedokteran New England bahwa kekebalan yang ada memiliki waktu yang jauh lebih sulit untuk melawan BA.5 dibandingkan dengan subvarian omicron sebelumnya. Jadi orang yang sebelumnya terinfeksi omicron pun bisa terinfeksi BA.5. Ini juga dapat menyebar lebih mudah di antara orang-orang, meskipun tampaknya tidak menyebabkan penyakit yang lebih parah.

BA.5 mungkin memimpin sekarang, tetapi ancaman Covid-19 di masa depan bisa terlihat sangat berbeda

Fakta bahwa omicron masih menyebar hanya dengan sedikit perubahan pada genomnya dibandingkan dengan varian sebelumnya menunjukkan bahwa kombinasi mutasinya sangat efektif untuk menyebar. Tapi itu tidak berarti bahwa versi masa depan dari SARS-CoV-2 hanya akan beralih dari BA.5. Versi SARS-CoV-2 yang sama sekali berbeda dapat muncul dan memulai proses dari awal lagi.

“Sementara hal-hal tampaknya setidaknya agak berbeda dengan omicron, dalam hal itu— [it’s] memunculkan begitu banyak subvarian yang sukses, saya tidak berpikir kita dapat mengesampingkan bahwa mungkin ada varian lain yang muncul secara tidak terduga, ”kata Hodcroft.

Apa yang bisa kita lakukan tentang ini?

Strategi terbaik adalah membatasi penyebaran virus, menyangkal peluangnya untuk bermutasi. Mendapatkan vaksinasi dan dorongan jika memenuhi syarat tetap penting, tidak hanya di AS, tetapi di seluruh dunia. Meskipun orang yang divaksinasi masih bisa terinfeksi BA.5, peluang mereka lebih rendah daripada mereka yang tidak diimunisasi, mereka cenderung tidak menyebarkannya ke orang lain, dan yang paling penting, jauh lebih kecil kemungkinannya untuk sakit parah.

Pembeli bermasker dan tanpa masker di pasar Santee Alley yang sangat padat pada Kamis, 14 Juli 2022 di Los Angeles, CA.

Subvarian BA.5 mendorong tingkat komunitas Covid-19 Los Angeles County ke “tinggi” pada pertengahan Juli.
Irfan Khan/Los Angeles Times via Getty Images

Perlu juga dicatat bahwa BA.5 sebenarnya terdeteksi di Afrika Selatan pada bulan Februari, tetapi hanya dalam sebulan terakhir ia mendapatkan momentum di AS. Ini menyoroti pentingnya pengawasan. Itu berarti melacak perubahan genetik pada virus dan pemantauan kesehatan masyarakat untuk menangkap lonjakan sebelum meletus.

Kekhawatirannya sekarang adalah bahwa, di AS, tingkat vaksinasi telah mencapai dataran tinggi meskipun sebagian besar populasi sekarang memenuhi syarat untuk mendapatkan suntikan Covid-19. Langkah-langkah kesehatan masyarakat seperti jarak sosial dan mandat masker hampir hilang. Dan dengan meningkatnya pengujian di rumah, banyak kasus tidak dilaporkan. Jadi sementara BA.5 mungkin tidak menyebabkan kerusakan yang sama seperti versi sebelumnya dari omicron, itu masih dapat menyebabkan banyak kesengsaraan saat rumah sakit penuh.

Bahkan sekarang, di tahun ketiganya, lintasan pandemi masih suram, dan virus itu masih bisa membawa kejutan yang tidak menyenangkan. “Apa yang dikatakan ini kepada kita: kita harus tetap waspada,” kata Barouch.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *