banner large

‘Barcode’ molekuler Manifold Bio dapat menembus kemacetan in vivo farmasi – TechCrunch

Comment
X
Share

Dalam pembuatan obat baru, ada titik di mana Anda akhirnya harus menempatkan molekul dalam makhluk nyata — satu per satu — dan melihat apakah itu benar-benar melakukan apa yang Anda pikirkan. Mesin molekuler Manifold Bio dapat membiarkan seratus molekul diuji secara bersamaan dalam satu sistem kehidupan, yang berpotensi menjungkirbalikkan seluruh proses.

Ruang penemuan obat telah berkembang pesat dalam beberapa tahun terakhir, pertama dengan transkripsi gen yang cepat dan murah, kemudian dengan CRISPR, kemudian dengan proteomik bertenaga AI. Anda tidak perlu tahu apa yang dilakukan semua itu, namun, untuk memahami bahwa pada akhirnya, tidak peduli seberapa cepat mereka mempercepat penelitian fundamental, in vivo pengujian tetap menjadi hambatan utama.

In vivo berarti “dalam kehidupan”, sebagai lawan dari in vitro (dalam gelas) atau in silico (simulasi), dan tikus adalah makhluk biasa yang mendapat kehormatan meragukan untuk menguji keamanan dan kemanjuran obat baru. Dan persamaan umumnya adalah: satu obat, satu tikus. Karena ini adalah bagian pengujian obat yang menantang secara logistik dan memakan waktu, biasanya dibiarkan sampai hanya ada segelintir molekul yang cukup yakin akan berhasil oleh perusahaan atau lab. Tetapi ini juga yang pertama — dan sering kali yang terakhir — saat salah satu dari obat-obatan ini benar-benar harus bekerja di tubuh nyata, dan hasilnya banyak yang hilang.

Masukkan Bio Manifold. Startup, dipersenjatai dengan $40 juta dalam pendanaan seri A, bertujuan untuk membuat pengujian tikus seratus kali lebih efisien dan efektif, mengubah persamaan itu dan memungkinkan pengujian in vivo lebih awal yang memverifikasi fungsi molekul. sebelum Anda membuang beberapa juta dolar sumber daya ke dalamnya.

“Lingkungan pengujian terbaik adalah kenyataan,” jelas pendiri dan CEO Manifold Bio, Gleb Kuznetsov. “Tetapi ketika Anda melangkah lebih jauh dalam program pengembangan obat, Anda berinvestasi semakin banyak, untuk melakukan eksperimen dan pekerjaan yang semakin mahal. Kami mengoptimalkan lebih awal, jadi begitu kami berada di gerbang terakhir untuk uji klinis, kami bergerak maju dengan obat yang telah dioptimalkan. Jika Anda dapat lebih yakin bahwa ini adalah obat yang tepat untuk diinvestasikan, Anda dapat mengatasi risiko utama dari investasi Anda.”

Saat ini, pada fase pengujian tikus, Anda biasanya memiliki kondisi target dan beberapa kandidat molekul obat. Satu masuk ke setiap mouse dan Anda mengamati apa yang terjadi — dan ada kemungkinan nyata mereka semua akan gagal pada tahap penting ini.

Inovasi Manifold memparalelkan pengujian in vivo dengan hingga seratus pengujian simultan dalam satu mouse. Untuk mewujudkannya, ia telah menemukan teknologi “pengkodean batang protein” yang mungkin Anda anggap sebagai tag RFID molekuler.

Ilustrasi beberapa “barcode” yang melekat pada protein untuk diuji in vivo.

“Cara kerjanya adalah kami melampirkan sedikit protein tambahan, kode batang protein kami, dan itu membuat protein dapat dilacak dan kami dapat melacaknya ke mana pun ia pergi dalam suatu sistem,” kata Kuznetsov. Daripada memverifikasi tes lab, “Ini lebih untuk menginformasikan desain. Ada banyak pengembangan yang didorong oleh AI dan pembelajaran mesin, banyak desain di komputer. Kami fokus pada target kanker tertentu, sesuatu di permukaan sel kanker yang benar-benar menandai bahwa ini adalah sel kanker, dan mencari tahu desain obat yang sangat spesifik untuk sel kanker itu — dan tidak mengarah ke tempat lain.”

Masalahnya di sini adalah bahwa pada tahap ini, Anda mungkin melihat seribu protein yang berbeda, yang masing-masing mungkin hanya berbeda dari yang lain oleh beberapa asam amino, blok pembangun yang memberi protein bentuk dan fungsinya.

Di situlah kode batang Manifold masuk. Setiap protein, betapapun serupa, mendapat tag yang benar-benar unik dan dapat diidentifikasi setelah dimasukkan melalui proses konversi DNA eksklusif. Jumlah yang sama dari 100 molekul masuk ke dalam tikus, mungkin 95 tidak melakukan apa-apa, 3 menempel pada kanker dengan baik, dan 2 menempel pada tingkat yang jauh lebih tinggi. Itu 98 molekul yang tidak perlu Anda ambil melalui pengujian lebih lanjut.

Proses penyaringan ini menghilangkan banyak ketidakpastian dari persamaan, karena Anda tahu pasti bahwa protein ini benar-benar melakukan apa yang Anda rancang untuk dilakukan, dalam sistem mamalia yang hidup. Dan ini tepat setelah desain dan sintesis volume rendah, relatif murah dan bagian awal dari proses.

Dari kiri, pendiri Manifold Gleb Kuznetsov, Shane Lofgren, dan Pierce Ogden.

Bagian yang sulit adalah mendesain tag itu sendiri. Jika Anda memikirkannya, setiap kode batang protein kecil harus memenuhi standar yang sangat tinggi.

“Ada komponen biologi molekuler tetapi ada juga banyak sisi komputasi untuk membuat hal-hal ini dapat dideteksi. Mereka juga tidak boleh mempengaruhi perilaku obat, dan mereka harus stabil, dapat dideteksi, unik, dan dapat diproduksi,” kata Kuznetsov. Merancang satu akan menjadi tantangan — merancang 100 bisa menjadi dasar dari jalur pengembangan obat yang sama sekali baru. Dia membandingkannya dengan perubahan yang terjadi dalam komputasi ketika kami beralih dari pemrosesan serial pada CPU ke pemrosesan paralel di GPU.

Untuk lebih jelasnya, ini bukan tentang pengujian supercharging di perusahaan lain – Manifold bertujuan untuk membangun seluruh perusahaan obat yang terintegrasi secara vertikal berdasarkan pendekatan pengujian yang diresapi biotek ini.

Seorang karyawan Manifold Bio bekerja di lab basah mereka.

“Kami akan melakukan end-to-end secara internal,” kata Kuznetsov. “Obat-obatan yang kami miliki di rumah, kami menciptakan molekul-molekul itu dari awal, kami memasukkannya ke dalam kumpulan tes in vivo ini, dan mereka akan segera berada di tingkat uji klinis.”

Putaran benih mereka adalah untuk membangun fondasi dan menunjukkan karya teknologi — yang sekarang telah dilakukan. Putaran $40MA adalah untuk memulai proses pengujian klinis yang lebih mahal dan standar. Perusahaan berfokus pada kanker untuk saat ini, karena itu bukan hanya ancaman besar tetapi juga cocok untuk jenis obat yang unggul dalam penemuan ini.

Perusahaan ini dijalankan oleh Kuznetsov dan rekan pendirinya, tetapi pelopor genetika George Church membantu menciptakan dan membangun perusahaan untuk memulai. Dia saat ini menjadi penasihat.

Putaran pendanaan baru dipimpin oleh Triatomic Capital, dengan partisipasi dari investor baru Bagian 32, FPV Ventures, Horizons Ventures, dan Tencent, dan investor lama Playground Global, Fifty Years, dan FAST oleh GETTYLAB.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *